元霜再次睁开眼的时候，又是几十年沧海桑田。
这个世界蒙古的铁骑攻破了大胜关，踏着郭靖黄蓉和无数英雄好汉的尸体入主中原，忽必烈在大都建立起元王朝，当时的第一大教全真教也被覆灭，天下第一大帮丐帮也没落了，郭家唯一幸存的只有郭襄。
襄阳城破前郭靖把杨过的玄铁重剑重铸成了倚天剑和屠龙刀，他在倚天剑中藏了九阴真经和降龙十八掌的秘籍，学之天下无敌，在屠龙刀中藏了武穆遗书，得到它可以战无不胜，攻无不克。
郭靖自知守城无望，将屠龙刀和倚天剑分别交给儿子郭破虏和女儿郭襄，希望有一天后人能取出其中藏着的秘密，将蒙古鞑子赶出中原。
可是江湖中人不知其中秘辛，只知道“武林至尊，宝刀屠龙，号令天下，莫敢不从，倚天不出，谁与争锋。”由此引发了对屠龙宝刀和倚天剑的争夺。
而今江湖也又是一番更新换代，以少林，武当，峨眉，昆仑，华山，崆峒六大门派为首。
这少林、武当、峨眉三家渊博颇深。
少林觉远大师临终前传授郭襄、张君宝和少林无色禅师九阳真经，但三人都并未记全。无色禅师传下来的是少林九阳功，郭襄看破红尘出家为尼，创立了峨眉派后传下的是峨眉九阳功，而张君宝更名张三丰创立了武当派，传下武当九阳功。
这三派的九阳功虽都来自九阳神功，可效果却比不得真正的九阳神功。
郭襄自父亲处得到了倚天剑，传给了历任峨眉掌门，没有人敢去抢夺。
而屠龙刀原本在她弟弟郭破虏手上，襄阳城破郭破虏身死后就流落江湖，引起腥风血雨，毕竟宝刀屠龙，号令天下的诱惑让人不得不趋之若鹜。
江湖上还崛起了另一方势力，传自波斯的中土明教。明教其实历经了几个朝代，先后组织了多次农民起义，但一直都被打压。自阳顶天当上明教教主后，才带领明教快速发展，一手乾坤大挪移，力压群雄，明教中人才辈出，聚集了左右使者、四大法王、五散人和五行旗主等高手，一时间明教风头大盛。
但阳顶天不明不白地死后，明教群龙无首，便也开始四分五裂。
金毛狮王谢逊在争夺屠龙刀时带着屠龙刀不知所踪，紫衫龙王黛绮丝因为其夫银叶先生之死叛离明教，白眉鹰王殷天正自立门户创立了天鹰教，青翼蝠王韦一笑远遁西域隐居，右使范遥也离开明教不知去向。
明教只剩下左使杨逍坐镇，五散人不服杨逍代掌明教事务也纷纷离开光明顶，明教自此分崩离析。
明教教众众多，一直以驱逐鞑虏，光复汉室为己任，而六大门派也因不归顺元朝廷而处处收到打压。
本来两方都是以抗元大业为要，就算不联手，也不应水火不容，可是六大门派有很多人因为各种原因死在了明教手上，双方结下了不死不休的仇恨。
昆仑派因为跟明教同处昆仑山脉，明教势力扩张威胁到了昆仑派的地位，当时的掌门灵宝道长挑战阳顶天失败后气愤而死，他的两个弟子为了给师傅报仇也死在了左使杨逍手里，自此昆仑派和明教结下了死仇。
在昆仑派的挑唆下，峨眉派的孤鸿子为了替昆仑派出头约战杨逍，被杨逍羞辱后气病而死，就导致峨眉现任掌门灭绝师太因为心爱的师兄之死仇恨明教，金毛狮王谢逊还杀害了她兄长，后来她最为看重的弟子纪晓芙又爱上了仇人杨逍，还为他生了孩子，让她对明教更是恨之入骨。
孤鸿子死后，少林派出渡厄、渡难、渡劫三位高僧对战阳顶天，不仅被打败，渡厄还被打瞎了一只眼睛。
后来金毛狮王谢逊的师傅成昆化作圆真隐藏在少林，骗空见神僧化解他和谢逊的恩怨，导致空见神僧为感化谢逊不慎死在“七伤拳”下，这下更是仇上加仇，少林将罪过一并算在明教头上。
这圆真和尚原是混元霹雳手成昆，是明教教主阳顶天夫人的师兄，当时阳顶天横刀夺爱，抢走了成昆的未婚妻，这让成昆发誓要覆灭明教，杀了阳顶天。
所以他处处挑拨各大派和明教的关系，就是想让明教成为众矢之的以报夺妻之恨。期间他与阳夫人在光明顶密道私会，被阳顶天发现，害得阳顶天走火入魔而死，他心爱的师妹也因愧疚自尽而亡，腹中还怀着他的骨肉。
阳夫人之死更是让成昆彻底癫狂，在得知徒弟谢逊成为了明教的金毛狮王后，设计杀害了谢逊全家，引得谢逊在江湖上大开杀戒，冒名成昆四处作案。
而成昆此时却已遁入少林，拜入空见大师门下，后又利用空见大师的慈悲心设计谢逊杀害了空见大师，导致少林和明教的仇恨愈加不死不休。
谢逊后来为了争夺屠龙刀更是杀了江湖上不少人，俨然已经是武林公敌。
而崆峒派与明教结仇则是由于谢逊夺取了他们的《七伤拳谱》，打伤了崆峒五老，还用它杀害了空见神僧。
至于华山派，掌门鲜于通是个始乱终弃的小人，当初为了掌门之位娶了掌门的女儿为妻，抛弃了蝶谷医仙胡青牛的妹妹胡青羊，胡青羊伤心欲绝之下带着腹中孩儿上吊自尽。事后鲜于通更是为了隐藏秘密杀害了师兄白垣嫁祸给明教。
最后的武当派则是先与天鹰教结仇。武当七侠老三俞岱岩不慎卷入屠龙刀之争，被天鹰教殷素素打伤，在镖局把他送回武当途中又遭了暗算导致全身瘫痪，成为废人。
这其中自然也有成昆的手笔，他勾结元朝汝阳王府，用大力金刚指将俞岱岩四肢尽碎。
后来殷素素在争夺屠龙刀时不慎和武当五侠张翠山还有金毛狮王谢逊一起流落冰火岛，两人产生了感情还生了张无忌。
十年后一家三口返回中原，张无忌被汝阳王府抓走，不但被逼问谢逊和屠龙刀的下落，还中了玄冥二老的玄冥神掌。
在武当张真人百岁寿宴时，武林人士上门逼迫两夫妻，恰逢殷素素打伤俞岱岩之事暴露，张翠山因愧对三哥自刎而死，殷素素也随之殉情，留下身中玄冥神掌命不久矣的张无忌。
可以说明教以一己之力得罪了整个中原武林，虽然其中有部分是成昆挑唆的，但明教自身行事不正，也逃脱不了干系，这也为之后六大门派围攻光明顶种下了祸根。